בספירת העומר אנו אומרים "ולתקן את נפשותינו ורוחותינו ונשמותינו מכל סיג ופגם". איך יכול להיות שחטא פוגם בנשמה?

על פי הכתוב באור החיים בפירושו לפרשת אמור אין החטא גורם פגם בנשמה, אולם הוא ממעט את יכולתה להאיר ויש לה צער גדול בהרבה מצער הנפש שנפגמה.