הסיבה לכך שיש למחות דווקא את העם העמלקי , למצווה זו יש גם היגיון מוסרי, לפיו יש להרתיע את הרשעים , האם עמלקי יכול לחזור בתשובה או להתגייר , כיצד קרה שמבני בניו של המן יצאו תלמידי חכמים, האם ניתן להחיל את המצווה גם בימינו.
חיוב למחות את עמלק נובע מכך שהוא סותר את התגלות הקב"ה בארץ, ומפריד בין המוח ללב. עמלק פוגע בעם ישראל על ידי הקרירות, משיכת הכח לתאוות, ואמירה שכל העולם הוא מקרה, ושם צריך להלחם בו. בפורים יש כוח של ברכות בגלל שבו נעשים שותפים כביכול של הקב"ה ביצירת העולם.
עם ישראל שונה מכל העמים בגלל מדרגת קרבת אלוקים שלו, והמלחמה היא על עצם קיומו של עם ישראל.תפקידו של מלך המשיח להשמיד ולהכרית את זרעו של עמלק ולהילחם את כל מלחמות ה'.
עמלק מבטא את שורש הרע בעולם, והוא שהתחיל את שנאת ישראל בעולם * רק לאחר ביעור הרע תוכל להיות שמחה שלמה בעולם * עמלקי שקיבל עליו לשמור שבע מצוות בני נח, יצא מגדר עמלקי ואין למחותו * לפני יציאה למלחמה בעמלק פותחים בהצעת שלום * מחלוקת הפוסקים האם עמלקי יכול להתגייר * האם מי שמקפיד לאכול בשר חלק יכול לאכול אצל מי שאינו מקפיד * באכילה במסעדות בשריות יש להקפיד דווקא על כשרות למהדרין מטעם גוף כשרות ידוע ונאמן
עמלק עומד כנגד עם ישראל, מפני שהוא מתנגד לייצוגו של ה' בעולם. היות עמלק שורש הכפירה והשנאה שאין להם יסוד רציונאלי, מחייבת להשמיד אותו בלא להיכנס לשיח עמו. גם אל עמלק שבפנימיות – המנתק בין השכל והרגש, ובכך יוצר ספיקות רגשיים בנוגע למושכלות, יש להתייחס באותה הדרך.
לפעמים הטומאה מגיעה גם לתוך הקדש, כמו בספר תורה שכתבו מין: יש אומרים שיש להוציא אזכרות שם ה' מתוכו ולשרוף שאר הספר ויש אומרים שיש לשורפו עם האזכרות שבו. כך בפורים עלינו למחות את עמלק ברמת הקדש.
